20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2475 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2475  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1246    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.641856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0364  hypothetical protein  46.43 
 
 		 683 aa  495  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2958  hypothetical protein  27.32 
 
 		 609 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4071  hypothetical protein  28.19 
 
 		 640 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184175  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1656  hypothetical protein  27.11 
 
 		 627 aa  169  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.558221  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0339  hypothetical protein  27.09 
 
 		 639 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.809143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3877  hypothetical protein  23.57 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.413132  normal  0.0515255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3685  hypothetical protein  21.98 
 
 		 549 aa  59.3  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3673  hypothetical protein  21.69 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0272  hypothetical protein  23.52 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0276  hypothetical protein  28.87 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0306  hypothetical protein  29.47 
 
 		 503 aa  54.3  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3442  hypothetical protein  21.56 
 
 		 550 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.325746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4062  hypothetical protein  23.53 
 
 		 548 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3984  hypothetical protein  23.58 
 
 		 548 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4180  hypothetical protein  23.58 
 
 		 548 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0230  hypothetical protein  28.78 
 
 		 569 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.769697  normal  0.583487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4093  hypothetical protein  30.16 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245434  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0379  hypothetical protein  22.42 
 
 		 543 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3352  hypothetical protein  31.73 
 
 		 546 aa  44.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>