18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2095 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2095  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  384  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1325  hypothetical protein  88.59 
 
 
205 aa  352  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125239  normal  0.126591 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0088  hypothetical protein  72.53 
 
 
235 aa  293  8e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235222  normal  0.0227484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3492  twin-arginine translocation pathway signal  69.57 
 
 
236 aa  283  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0129  hypothetical protein  34.39 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  27.81 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4064  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  26.84 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1353  hypothetical protein  29.24 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.187425  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1596  hypothetical protein  28.65 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  26.74 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  26.32 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13153  hypothetical protein  36 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0280148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  25.77 
 
 
827 aa  67.8  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0450  hypothetical protein  28.57 
 
 
220 aa  64.3  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4595  hypothetical protein  27.06 
 
 
212 aa  59.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.6728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  23.96 
 
 
280 aa  58.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2769  double-transmembrane region-like  22.92 
 
 
929 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.676495  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>