23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1617 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2733  hypothetical protein  56.99 
 
 
570 aa  635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  hitchhiker  0.00174807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1617  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1176    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0549  hypothetical protein  50.52 
 
 
542 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0550  hypothetical protein  46.29 
 
 
523 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0336  hypothetical protein  55.91 
 
 
492 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0136782  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0552  hypothetical protein  45.57 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.677753  normal  0.24778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0551  hypothetical protein  41.05 
 
 
501 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0557  hypothetical protein  41.33 
 
 
487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0555  hypothetical protein  40.92 
 
 
442 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.589483  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0556  hypothetical protein  34.11 
 
 
515 aa  280  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.253273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2081  hypothetical protein  40.2 
 
 
444 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.252224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0558  hypothetical protein  37.72 
 
 
467 aa  258  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.675961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2082  hypothetical protein  39.57 
 
 
476 aa  252  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  0.181535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0337  hypothetical protein  39.14 
 
 
448 aa  250  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2732  hypothetical protein  32.75 
 
 
449 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  hitchhiker  0.00119476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2083  hypothetical protein  34.97 
 
 
493 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  0.196729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0548  hypothetical protein  36 
 
 
390 aa  237  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1618  hypothetical protein  34.75 
 
 
475 aa  224  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.483238  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5342  hypothetical protein  29.23 
 
 
426 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0256  DoxX family protein  28.8 
 
 
448 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4334  hypothetical protein  30.46 
 
 
445 aa  66.6  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0868  hypothetical protein  25.1 
 
 
459 aa  64.3  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06020  hypothetical protein  25.57 
 
 
353 aa  63.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.305074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>