27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1363 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1363  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2571  hypothetical protein  31.18 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850866  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3514  hypothetical protein  25.97 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1633  hypothetical protein  26.04 
 
 
259 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0146  hypothetical protein  25.52 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.445044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6310  hypothetical protein  25.76 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.639142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0086  hypothetical protein  28.66 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2213  hypothetical protein  27.96 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3204  hypothetical protein  27.98 
 
 
258 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.014379  normal  0.501586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1808  hypothetical protein  28.92 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2564  hypothetical protein  25.37 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2278  hypothetical protein  22.86 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.869432  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5504  hypothetical protein  28.48 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1722  hypothetical protein  24.15 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2346  hypothetical protein  26.95 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.519999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3619  hypothetical protein  28.9 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142285  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1969  hypothetical protein  25.88 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1589  hypothetical protein  25.75 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2151  hypothetical protein  23.87 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0128892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3366  hypothetical protein  25.6 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1956  hypothetical protein  26.19 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0268336  hitchhiker  0.00000346818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2531  hypothetical protein  26.95 
 
 
269 aa  45.4  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1549  hypothetical protein  25.15 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.237876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1064  hypothetical protein  26.55 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1793  hypothetical protein  28.85 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2156  hypothetical protein  28.85 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13600  hypothetical protein  27.1 
 
 
307 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.487374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>