19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1272 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 338 aa  695    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.15 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.591027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2360  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.3 
 
 		 338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0972  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.11 
 
 		 347 aa  361  8e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00933652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 		 338 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.11 
 
 		 343 aa  303  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.66 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0270  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.61 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.61 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1646  putative dehydratase  24.61 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  25.59 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0205  hypothetical protein  24.4 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  25.67 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>