67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0672 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  306  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  56.85 
 
 		 145 aa  180  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  57.53 
 
 		 147 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  51.03 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  52.05 
 
 		 148 aa  161  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  50.66 
 
 		 154 aa  158  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.37 
 
 		 148 aa  153  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  41.96 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  44.93 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  38.03 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  34.53 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  30.77 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  31.69 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  32.17 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  33.1 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  30.14 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  28.77 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  28.28 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  30.16 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  30.77 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  31.21 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  29.5 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  33.04 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  26.67 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  27.46 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  31.47 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  29.1 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  28.67 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  30.5 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1077  hypothetical protein  27.4 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  27.78 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  24.48 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  28.15 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  25.36 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  30.89 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  26.57 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  29.79 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  24.35 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  30.08 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  27.54 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  25.83 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  29.87 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  29.94 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  32.77 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  26.45 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  29.75 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  29.75 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  26.24 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  29.53 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  27.86 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  25.87 
 
 		 174 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  29.91 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  24.03 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  23.48 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  22.45 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  23.78 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  23.73 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  29.41 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  27.64 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  23.58 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1757  phage tail protein  27.69 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  25.38 
 
 		 166 aa  40  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  24.17 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>