42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0473 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  65.95 
 
 		 514 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 521 aa  1079    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  58.37 
 
 		 512 aa  618  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  51.06 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  45.11 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  42.52 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  33.92 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  33.47 
 
 		 504 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  34.87 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  32.78 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  34.58 
 
 		 502 aa  274  3e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  32.71 
 
 		 484 aa  270  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  33.47 
 
 		 504 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  33.07 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  33.2 
 
 		 509 aa  263  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  34.54 
 
 		 514 aa  260  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  34.54 
 
 		 514 aa  260  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  31.67 
 
 		 508 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  32.71 
 
 		 507 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  33.61 
 
 		 500 aa  250  5e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  32.8 
 
 		 495 aa  247  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  32.62 
 
 		 497 aa  246  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  32.99 
 
 		 527 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  32.99 
 
 		 502 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  32.5 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  31.4 
 
 		 522 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  33.2 
 
 		 562 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  30.88 
 
 		 494 aa  236  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  32.56 
 
 		 496 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  29.7 
 
 		 497 aa  229  8e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  31.55 
 
 		 528 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  31.13 
 
 		 530 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  31.38 
 
 		 539 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  28.14 
 
 		 528 aa  199  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  23.01 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  21.7 
 
 		 559 aa  71.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  26.62 
 
 		 557 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  21.99 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  22.19 
 
 		 509 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  28 
 
 		 417 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  19.22 
 
 		 526 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  21.28 
 
 		 532 aa  43.5  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>