13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0561 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0561  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  279  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605837  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0587  hypothetical protein  90 
 
 
140 aa  248  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_526  hypothetical protein  89.29 
 
 
140 aa  244  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000558785  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1214  hypothetical protein  31 
 
 
143 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000175016  normal  0.800065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0735  hypothetical protein  31.58 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2519  hypothetical protein  31.13 
 
 
138 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2642  hypothetical protein  32.74 
 
 
137 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3352  hypothetical protein  28.8 
 
 
123 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4062  hypothetical protein  26.98 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3222  hypothetical protein  25.35 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06880  hypothetical protein  28.57 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0333  hypothetical protein  35.45 
 
 
134 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00389128  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1884  hypothetical protein  39.68 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000308697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>