18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0256 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0256  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1452  hypothetical protein  51.24 
 
 
203 aa  208  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.324561  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2749  hypothetical protein  50.75 
 
 
203 aa  204  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.815887  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5070  hypothetical protein  42.11 
 
 
174 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0686  hypothetical protein  42.11 
 
 
174 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4007  hypothetical protein  40.94 
 
 
174 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0931  putative bacteriophage protein  43.24 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678371  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1044  hypothetical protein, putative phage gene  41.38 
 
 
196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0913  phage-like protein  38.55 
 
 
211 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2919  phage protein  37.43 
 
 
195 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0894575  hitchhiker  0.000000000302279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3475  phage protein  37.43 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2784  phage protein  37.43 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0715  putative bacteriophage protein  37.87 
 
 
176 aa  121  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.851836  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1038  hypothetical protein  40.14 
 
 
219 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1301  hypothetical protein  32.34 
 
 
210 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05043  hypothetical protein  34.39 
 
 
166 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0571  hypothetical protein  37.67 
 
 
240 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809669  normal  0.240365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0739  hypothetical protein  33.16 
 
 
212 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.105419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>