19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3389 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  100 
 
 
240 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1301  baseplate assembly protein, putative  56.78 
 
 
241 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  54.42 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  33.09 
 
 
360 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  33.63 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  25.19 
 
 
364 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  24.28 
 
 
567 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  28.95 
 
 
359 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  28.95 
 
 
359 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  24.28 
 
 
567 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  24.02 
 
 
567 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  26.15 
 
 
543 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  30.97 
 
 
323 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  26.54 
 
 
551 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  25.13 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  27.7 
 
 
231 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  25.17 
 
 
321 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  26.81 
 
 
541 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  24.77 
 
 
565 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>