15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0932 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0932  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  320  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0644252  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1888  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  320  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0320965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3816  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  320  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  29.45 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  29.45 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  27.34 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  29.08 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  25.35 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  25.37 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  26.62 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  22.76 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  27.4 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  25.87 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  24.66 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  24.82 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>