14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4030 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4030  putative phage tail fibre protein  100 
 
 
125 aa  255  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4028  putative phage tail fibre protein  97.6 
 
 
125 aa  249  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4041  hypothetical protein  33.59 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000721668 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4390  hypothetical protein  36.36 
 
 
172 aa  53.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2056  hypothetical protein  28.57 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1306  hypothetical protein  46.43 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000530633 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2747  tail fiber assembly protein, putative  32.39 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3394  hypothetical protein  42 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2376  hypothetical protein  49.09 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000344469  unclonable  0.0000000178231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0189  hypothetical protein  45.16 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08060  putative tail fiber assembly protein  27.86 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  6.34123e-16  hitchhiker  0.000172643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1223  hypothetical protein  41.27 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2230  hypothetical protein  34.43 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3730  hypothetical protein  27.93 
 
 
223 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>