21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2097 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2097  hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  1086    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1877  hypothetical protein  82.82 
 
 
519 aa  937    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2098  hypothetical protein  39.64 
 
 
351 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217218  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4187  hypothetical protein  36.62 
 
 
366 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637966  hitchhiker  0.00122785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2983  hypothetical protein  34.09 
 
 
356 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3136  hypothetical protein  33.81 
 
 
356 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  37.36 
 
 
594 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5987  hypothetical protein  34.48 
 
 
370 aa  193  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.373978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0631  hypothetical protein  30.23 
 
 
343 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107314  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2509  hypothetical protein  32.9 
 
 
367 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0383  hypothetical protein  29.44 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0289  hypothetical protein  30.58 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.929671  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1097  hypothetical protein  26.67 
 
 
384 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2855  hypothetical protein  26.67 
 
 
384 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2702  hypothetical protein  26.54 
 
 
384 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  25.78 
 
 
137 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2330  VioB - polyketide synthase  24.15 
 
 
1069 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0866221  hitchhiker  0.0021675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4291  hypothetical protein  23.15 
 
 
324 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  22.22 
 
 
136 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  25.19 
 
 
137 aa  44.3  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  20.72 
 
 
134 aa  43.9  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>