31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1272 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1272  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  241  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  79.66 
 
 		 360 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.17 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  36.23 
 
 		 364 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  35.48 
 
 		 367 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.48 
 
 		 367 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  35.48 
 
 		 367 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  35.48 
 
 		 367 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  35.48 
 
 		 367 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  35.48 
 
 		 367 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  35.48 
 
 		 367 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  35.48 
 
 		 367 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  35.48 
 
 		 367 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  35.48 
 
 		 367 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  34.41 
 
 		 367 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  34.41 
 
 		 367 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  34.41 
 
 		 367 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  34.41 
 
 		 367 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  34.41 
 
 		 367 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  30.56 
 
 		 365 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  34.94 
 
 		 369 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  34.94 
 
 		 369 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  34.94 
 
 		 369 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  34.94 
 
 		 369 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  40 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 		 368 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 		 374 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  28.57 
 
 		 374 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  31.03 
 
 		 367 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 		 365 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  30 
 
 		 376 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>