25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1301 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1301  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  342  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.653064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0605  hypothetical protein  25.62 
 
 
203 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1593  hypothetical protein  23.63 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2819  hypothetical protein  23.63 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.524505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1701  hypothetical protein  23.63 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01104  hypothetical protein  24.19 
 
 
180 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01112  hypothetical protein  24.19 
 
 
180 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1231  hypothetical protein  24.19 
 
 
180 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2493  hypothetical protein  24.19 
 
 
180 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.717674  hitchhiker  0.000000248387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003998  putative esterase  24.86 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1488  hypothetical protein  24.19 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123276 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2215  hypothetical protein  24.19 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481458  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2018  hypothetical protein  24.19 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1230  hypothetical protein  24.19 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00205338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2539  protein of unknown function UPF0227  24.19 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0228529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0584  protein of unknown function UPF0227  24.73 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0989  hypothetical protein  25.53 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.271686  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0845  hypothetical protein  25.53 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.294415  normal  0.359517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3357  hypothetical protein  26.34 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0517528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00184  hypothetical protein  23.72 
 
 
165 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1808  hypothetical protein  30.93 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0130778  normal  0.0374625 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1310  hypothetical protein  23.33 
 
 
183 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4969  hypothetical protein  23.5 
 
 
202 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1925  hypothetical protein  23.08 
 
 
180 aa  40.8  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.389564  hitchhiker  0.0000253614 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1294  protein of unknown function UPF0227  23.24 
 
 
184 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.497416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>