52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2221 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2221  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  676    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3313  hypothetical protein  47.2 
 
 
351 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4359  hypothetical protein  39.08 
 
 
358 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0643  hypothetical protein  36.42 
 
 
357 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4945  hypothetical protein  35.03 
 
 
343 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000030592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2562  hypothetical protein  34.22 
 
 
346 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1518  hypothetical protein  31.43 
 
 
363 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.913415  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2232  hypothetical protein  34.94 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1876  hypothetical protein  34.71 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05130  uncharacterized membrane protein  35.09 
 
 
335 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1879  hypothetical protein  31.34 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2010  hypothetical protein  32.93 
 
 
355 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2884  hypothetical protein  24.4 
 
 
352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0857  hypothetical protein  33.24 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.549671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2565  hypothetical protein  24.47 
 
 
350 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2507  transporter  33.85 
 
 
341 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0167  hypothetical protein  34.55 
 
 
361 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0308  hypothetical protein  25.98 
 
 
355 aa  126  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3490  hypothetical protein  30.72 
 
 
354 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0707746  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2248  hypothetical protein  30.72 
 
 
354 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.284315  normal  0.730008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23450  hypothetical protein  29.67 
 
 
351 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1661  hypothetical protein  33.23 
 
 
348 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0299  hypothetical protein  26 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2710  hypothetical protein  30.97 
 
 
369 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210144  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07920  uncharacterized membrane protein  34.57 
 
 
385 aa  117  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279282  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0677  hypothetical protein  25.62 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.202663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0692  hypothetical protein  25.62 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0235088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1765  hypothetical protein  27.84 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0081  hypothetical protein  26.3 
 
 
367 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00405626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3295  hypothetical protein  28.83 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1874  hypothetical protein  28.49 
 
 
346 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2014  hypothetical protein  28.83 
 
 
346 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.85804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1840  hypothetical protein  28.49 
 
 
346 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.406982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2091  hypothetical protein  28.49 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.295909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2125  hypothetical protein  28.49 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.586239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2046  hypothetical protein  28.49 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00084703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1870  hypothetical protein  28.49 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2012  hypothetical protein  28.49 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1824  hypothetical protein  28.49 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1519  hypothetical protein  27.62 
 
 
347 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25260  uncharacterized membrane protein  27.64 
 
 
381 aa  109  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.461148  normal  0.040821 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2592  hypothetical protein  26.42 
 
 
359 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2540  hypothetical protein  26.42 
 
 
359 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0891  hypothetical protein  26.86 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0471  hypothetical protein  25.77 
 
 
414 aa  90.9  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12490  uncharacterized membrane protein  28.91 
 
 
459 aa  87  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21530  uncharacterized membrane protein  23.14 
 
 
408 aa  85.9  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.198401  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2079  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0108  hypothetical protein  25.66 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0108219  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1461  hypothetical protein  30.88 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0143143  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1817  hypothetical protein  28.99 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1835  uncharacterized membrane protein  21.41 
 
 
326 aa  47.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>