20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0380 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0380  hypothetical protein  100 
 
 
540 aa  1103    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0300  hypothetical protein  47.68 
 
 
498 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1178  hypothetical protein  46.92 
 
 
496 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2248  hypothetical protein  35.93 
 
 
495 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000920075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0629  hypothetical protein  31.46 
 
 
513 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2033  hypothetical protein  28.12 
 
 
499 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0247  hypothetical protein  27.84 
 
 
487 aa  174  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2800  hypothetical protein  27.11 
 
 
545 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2869  hypothetical protein  26.52 
 
 
545 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.265474  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3863  hypothetical protein  26.42 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1493  hypothetical protein  26.8 
 
 
505 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.22386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3977  hypothetical protein  24.61 
 
 
565 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_003296  RS03692  hypothetical protein  26.95 
 
 
517 aa  97.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.274894  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0540  hypothetical protein  27.11 
 
 
532 aa  93.6  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0489  hypothetical protein  24.42 
 
 
540 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0248447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1084  hypothetical protein  25.81 
 
 
671 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0110678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0871  hypothetical protein  24.61 
 
 
492 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0170  hypothetical protein  28.82 
 
 
517 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2614  hypothetical protein  26.5 
 
 
509 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000491274  normal  0.0136523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5502  hypothetical protein  24.55 
 
 
529 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000845668  decreased coverage  0.000369985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>