80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3613 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  100 
 
 		 146 aa  304  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  76.26 
 
 		 144 aa  235  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  65.47 
 
 		 142 aa  206  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  57.93 
 
 		 147 aa  184  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  57.86 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  53.24 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  52.11 
 
 		 156 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  52.11 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  51.8 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  51.8 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  52.78 
 
 		 157 aa  153  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  47.14 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  38.13 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  40.28 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  42.54 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  38.52 
 
 		 142 aa  100  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  41.3 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  37.93 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  38.52 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  39.13 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  36.23 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  39.42 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  38.69 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  38.69 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  40.15 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  42.37 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  32.84 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  35.21 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  35.46 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  34.48 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  34.27 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  32.17 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  35.33 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  36.49 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  34.69 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  29.79 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  33.55 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  34.48 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  34.97 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  33.58 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.08 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  32.19 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  34.25 
 
 		 176 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  31.65 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  30 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  32.5 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  31.94 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  31.65 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  32.41 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  27.97 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  31.47 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  31.15 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  30.72 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  28.19 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  27.34 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  29.91 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  31.54 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  30.22 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  33.8 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  29.5 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  30.23 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  31.85 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  26.5 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1757  phage tail protein  28.08 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  24.11 
 
 		 178 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  31.85 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  29.77 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  30.15 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  32.61 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  26.35 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  32.61 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1129  hypothetical protein  26.71 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  24.34 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  23.53 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  30.82 
 
 		 159 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>