13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3227 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3227  proline-rich transmembrane protein  100 
 
 		 173 aa  345  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1299  prolin-rich transmembrane protein  34.97 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.033846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2584  putative prolin-rich transmembrane protein  35.04 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1986  hypothetical protein  33.67 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0936785  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3883  hypothetical protein  40.91 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2415  putative prolin-rich transmembrane protein  29.65 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1337  hypothetical protein  36.21 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29110  hypothetical protein  32.65 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189229  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4707  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.813409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2292  hypothetical protein  28.79 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2458  hypothetical protein  26.87 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2304  hypothetical protein  40.32 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.221973  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2467  hypothetical protein  29.69 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.564543  normal  0.906023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>