13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3970 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3970  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.730732  normal  0.0840614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2832  hypothetical protein  64.42 
 
 
191 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1991  hypothetical protein  64.79 
 
 
180 aa  181  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1807  hypothetical protein  65.94 
 
 
173 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2714  hypothetical protein  56.55 
 
 
167 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3044  hypothetical protein  40.15 
 
 
164 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0786662  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0668  hypothetical protein  30.41 
 
 
179 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3559  hypothetical protein  39.39 
 
 
165 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0789  hypothetical protein  31.21 
 
 
171 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1142  hypothetical protein  32.35 
 
 
180 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1164  hypothetical protein  32.35 
 
 
180 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0732  hypothetical protein  26.85 
 
 
171 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0719  hypothetical protein  26.85 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>