52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0167 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0167  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1879  hypothetical protein  56.36 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2248  hypothetical protein  55.78 
 
 		 354 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.284315  normal  0.730008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3490  hypothetical protein  55.78 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0707746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2010  hypothetical protein  56.42 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0308  hypothetical protein  30.51 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1518  hypothetical protein  33.63 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.913415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0692  hypothetical protein  28.29 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0235088  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0677  hypothetical protein  28.29 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.202663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0643  hypothetical protein  37.46 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12490  uncharacterized membrane protein  40.54 
 
 		 459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2232  hypothetical protein  36.25 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0081  hypothetical protein  29.83 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00405626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0471  hypothetical protein  32.4 
 
 		 414 aa  153  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1876  hypothetical protein  37.54 
 
 		 385 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0857  hypothetical protein  36.21 
 
 		 354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.549671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05130  uncharacterized membrane protein  33.65 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2079  hypothetical protein  30.57 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2221  hypothetical protein  34.55 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3313  hypothetical protein  32.36 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2884  hypothetical protein  22.32 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25260  uncharacterized membrane protein  27.15 
 
 		 381 aa  125  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.461148  normal  0.040821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2565  hypothetical protein  23.01 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2562  hypothetical protein  28.79 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21530  uncharacterized membrane protein  27.72 
 
 		 408 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.198401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4945  hypothetical protein  28.03 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000030592  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07920  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2710  hypothetical protein  28.17 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4359  hypothetical protein  25.69 
 
 		 358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0299  hypothetical protein  25.82 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23450  hypothetical protein  29.77 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1840  hypothetical protein  25.53 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.406982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2125  hypothetical protein  25.53 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.586239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2091  hypothetical protein  25.53 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.295909  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1519  hypothetical protein  24.63 
 
 		 347 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3295  hypothetical protein  24.17 
 
 		 346 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2046  hypothetical protein  25.53 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00084703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1824  hypothetical protein  25.53 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1870  hypothetical protein  25.53 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2012  hypothetical protein  25.53 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2014  hypothetical protein  24.17 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.85804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1874  hypothetical protein  25.45 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2507  transporter  29.91 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1765  hypothetical protein  25.08 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0891  hypothetical protein  25.85 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139319  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1661  hypothetical protein  29.13 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1461  hypothetical protein  26.24 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0143143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1817  hypothetical protein  27.76 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0108  hypothetical protein  25.63 
 
 		 371 aa  53.1  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0108219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1835  uncharacterized membrane protein  21.53 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>