10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3455 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3455    100 
 
 
635 bp  1259    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2649  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
279 bp  553  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2795    95.97 
 
 
701 bp  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3681    94.8 
 
 
687 bp  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3735    94.4 
 
 
692 bp  385  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000165595  normal  0.066481 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0251    94.76 
 
 
385 bp  381  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.48928  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0254    94.35 
 
 
385 bp  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0263    93.88 
 
 
415 bp  220  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3322  hypothetical protein  96.67 
 
 
183 bp  206  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2338  hypothetical protein  86.02 
 
 
234 bp  73.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>