18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0298 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0298  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  306  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.532788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  27.82 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3627  hypothetical protein  33.87 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.805945  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3961  hypothetical protein  26.72 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  30.65 
 
 
232 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1018  hypothetical protein  29.01 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333587  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1248  hypothetical protein  28.68 
 
 
266 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  34.18 
 
 
204 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3151  hypothetical protein  26.39 
 
 
301 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2004  hypothetical protein  28.81 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.425505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2525  hypothetical protein  28.81 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6486  hypothetical protein  27.08 
 
 
301 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0643  hypothetical protein  32.91 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.908214  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3135  hypothetical protein  25.69 
 
 
348 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3132  hypothetical protein  26.24 
 
 
350 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880988  hitchhiker  0.00102312 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2522  hypothetical protein  25.69 
 
 
348 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3190  hypothetical protein  21.92 
 
 
349 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0127935  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3073  hypothetical protein  21.23 
 
 
312 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  0.376935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>