16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3214 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3214  hypothetical protein  100 
 
 		 661 aa  1350    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0140  protein of unknown function DUF324  27.44 
 
 		 615 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2524  hypothetical protein  26.38 
 
 		 744 aa  140  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  24.61 
 
 		 719 aa  133  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  32.15 
 
 		 666 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  27.32 
 
 		 711 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  28.25 
 
 		 698 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  25.56 
 
 		 699 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  24.49 
 
 		 712 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  24.6 
 
 		 698 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1679  hypothetical protein  25.9 
 
 		 501 aa  56.2  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.6131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1006  hypothetical protein  27.78 
 
 		 950 aa  56.2  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.601621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  25.48 
 
 		 699 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2394  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  48.9  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.621441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1148  hypothetical protein  20.79 
 
 		 796 aa  44.3  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  25.89 
 
 		 390 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>