16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2458 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2458  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  320  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2303  hypothetical protein  42.96 
 
 
148 aa  118  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0104  hypothetical protein  36.43 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0361  hypothetical protein  26.72 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0267181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1675  hypothetical protein  36.15 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194606  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2340  hypothetical protein  27.48 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1706  hypothetical protein  29.55 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1456  hypothetical protein  28.83 
 
 
198 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4179  hypothetical protein  28.91 
 
 
194 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3193  hypothetical protein  23.85 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2926  hypothetical protein  23.85 
 
 
206 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2973  hypothetical protein  32.04 
 
 
292 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.260564  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0667  hypothetical protein  40.26 
 
 
284 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1455  hypothetical protein  23.19 
 
 
223 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0373  hypothetical protein  32.69 
 
 
285 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0494  hypothetical protein  24.14 
 
 
150 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000850376  hitchhiker  0.00122996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>