14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1407 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1407  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1141  hypothetical protein  54.19 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0173277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2178  hypothetical protein  51.11 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303816  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1595  hypothetical protein  49.78 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00605594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0249  hypothetical protein  52.42 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0701  hypothetical protein  49.78 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1304  hypothetical protein  47.77 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.795946  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1555  hypothetical protein  38.64 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0170408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4918  hypothetical protein  28.25 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1815  VTC domain protein  30.94 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3014  hypothetical protein  24.74 
 
 		 243 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3169  hypothetical protein  26.24 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13170  VTC domain-containing protein  22.59 
 
 		 284 aa  42  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.733284 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0374  hypothetical protein  22.78 
 
 		 314 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>