23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0905 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0905  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
221 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1273  metal dependent phosphohydrolase  59.82 
 
 
226 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2828  metal dependent phosphohydrolase  58.45 
 
 
219 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1357  metal dependent phosphohydrolase  56.62 
 
 
219 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1692  metal dependent phosphohydrolase  57.01 
 
 
221 aa  254  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236518  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1668  metal dependent phosphohydrolase  55.05 
 
 
220 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3619  metal dependent phosphohydrolase  59.28 
 
 
220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000462008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1426  HDIG domain-containing protein  53.42 
 
 
219 aa  249  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000370136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1122  metal dependent phosphohydrolase  52.97 
 
 
219 aa  248  7e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000330666  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4075  metal dependent phosphohydrolase  54.13 
 
 
290 aa  237  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.574671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1772  HDIG domain-containing protein  50 
 
 
220 aa  221  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000373403  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0111  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 
267 aa  56.6  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0797  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1594  hypothetical protein  27.23 
 
 
360 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1538  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
274 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.360301 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1038  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
273 aa  45.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.791938  hitchhiker  0.0000298084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0150  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
184 aa  45.1  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345578  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0292  metal dependent phosphohydrolase  27.56 
 
 
258 aa  45.1  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1472  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.309943  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2070  hypothetical protein  25.37 
 
 
310 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.938257  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  35.58 
 
 
519 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1665  metal dependent phosphohydrolase  27.09 
 
 
272 aa  42.4  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0160653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.67 
 
 
467 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>