52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0643 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0643  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  701    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1876  hypothetical protein  51.02 
 
 		 385 aa  285  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2232  hypothetical protein  45.77 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05130  uncharacterized membrane protein  48.28 
 
 		 335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0857  hypothetical protein  38.57 
 
 		 354 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.549671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2221  hypothetical protein  36.71 
 
 		 361 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1518  hypothetical protein  35.14 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.913415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2010  hypothetical protein  34.62 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4945  hypothetical protein  38.31 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000030592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1879  hypothetical protein  34.62 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0167  hypothetical protein  37.46 
 
 		 361 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.604308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0081  hypothetical protein  29.94 
 
 		 367 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00405626  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2248  hypothetical protein  34.12 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.284315  normal  0.730008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3313  hypothetical protein  33.43 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3490  hypothetical protein  34.12 
 
 		 354 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0707746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4359  hypothetical protein  32.75 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07920  uncharacterized membrane protein  36.68 
 
 		 385 aa  162  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2565  hypothetical protein  30.51 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2884  hypothetical protein  29.86 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0308  hypothetical protein  27.95 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2014  hypothetical protein  30.61 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.85804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0677  hypothetical protein  26.82 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.202663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0692  hypothetical protein  26.82 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0235088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2091  hypothetical protein  30.52 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.295909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1661  hypothetical protein  34.35 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1840  hypothetical protein  30.52 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.406982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1874  hypothetical protein  30.52 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2125  hypothetical protein  30.52 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.586239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2046  hypothetical protein  30.52 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00084703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1870  hypothetical protein  30.52 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1824  hypothetical protein  30.52 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2012  hypothetical protein  30.52 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1519  hypothetical protein  29.36 
 
 		 347 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3295  hypothetical protein  30.32 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2562  hypothetical protein  29.22 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2710  hypothetical protein  29.74 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23450  hypothetical protein  29.34 
 
 		 351 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1765  hypothetical protein  27.68 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0299  hypothetical protein  30.9 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0891  hypothetical protein  27.59 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139319  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25260  uncharacterized membrane protein  26.15 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.461148  normal  0.040821 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2540  hypothetical protein  25.99 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2592  hypothetical protein  25.99 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2507  transporter  29.13 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21530  uncharacterized membrane protein  26.6 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.198401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12490  uncharacterized membrane protein  26.25 
 
 		 459 aa  99.4  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0471  hypothetical protein  26.74 
 
 		 414 aa  97.4  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2079  hypothetical protein  24.61 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0108  hypothetical protein  24.58 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0108219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1835  uncharacterized membrane protein  23.94 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1817  hypothetical protein  20.4 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1461  hypothetical protein  22.69 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0143143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>