More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0344 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  100 
 
 		 390 aa  785    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  76.62 
 
 		 391 aa  581  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  63.05 
 
 		 414 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  63.05 
 
 		 414 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  63.05 
 
 		 414 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  61.64 
 
 		 409 aa  499  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  60.87 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  60.87 
 
 		 409 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  63.59 
 
 		 403 aa  490  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  61.11 
 
 		 383 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  60.93 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05030  malic enzyme  64.62 
 
 		 390 aa  483  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  57.62 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  57.88 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  63.05 
 
 		 412 aa  471  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  63.05 
 
 		 412 aa  471  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  63.31 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  57.36 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  58.03 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  57.36 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  57.36 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  57.36 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  63.05 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  57.36 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  62.53 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  62.53 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  62.53 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  62.53 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  62.53 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10070  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  61.64 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000523345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  62.73 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  62.73 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0401  malate dehydrogenase  63.5 
 
 		 407 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00944416 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  61.79 
 
 		 390 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  57.36 
 
 		 400 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  59.95 
 
 		 401 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  60.51 
 
 		 411 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.1 
 
 		 390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  60.7 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  60.43 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  61.87 
 
 		 403 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  60.05 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  60 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  58.56 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.52 
 
 		 407 aa  442  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1534  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  60.71 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1062  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  60.61 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00425454  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.49 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.49 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  55.15 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1912  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  58.87 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.96 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.29 
 
 		 503 aa  428  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3085  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  60.2 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000232423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.07 
 
 		 384 aa  428  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  54.46 
 
 		 757 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  56.68 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.33 
 
 		 489 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  54.21 
 
 		 752 aa  418  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  54.17 
 
 		 780 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  54.41 
 
 		 779 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.67 
 
 		 399 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2371  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.99 
 
 		 405 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.73 
 
 		 463 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  53.47 
 
 		 760 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  54.31 
 
 		 749 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  54.06 
 
 		 749 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  53.43 
 
 		 752 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  53.35 
 
 		 751 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  53.35 
 
 		 759 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  52.45 
 
 		 752 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  53.35 
 
 		 753 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  53.71 
 
 		 754 aa  408  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  52.09 
 
 		 771 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  58.56 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  54.21 
 
 		 752 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.88 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  56.25 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  54.84 
 
 		 751 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  55.88 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.37 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  53.22 
 
 		 754 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3983  malate dehydrogenase  58.06 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  54.27 
 
 		 457 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0112  NADP-dependent malic enzyme (NADP-me)  53.83 
 
 		 415 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2520  malate dehydrogenase  52.72 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6438  normal  0.0151254 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  52.81 
 
 		 754 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  53.19 
 
 		 749 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  54.2 
 
 		 469 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.95 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.6 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  53.58 
 
 		 773 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.37 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  54.23 
 
 		 417 aa  398  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  54.24 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1271  malate dehydrogenase  55.95 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000347822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  51.92 
 
 		 759 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  51.92 
 
 		 759 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  51.92 
 
 		 759 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0147  malate dehydrogenase  55.44 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>