16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0240 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0240  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.659958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2305  hypothetical protein  40.35 
 
 
242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310483  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03580  VTC domain-containing protein  30 
 
 
318 aa  121  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.102393 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0374  hypothetical protein  32.22 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4918  hypothetical protein  27.95 
 
 
299 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13170  VTC domain-containing protein  28.99 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.733284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1815  VTC domain protein  28.38 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2978  hypothetical protein  26.47 
 
 
227 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1141  hypothetical protein  26.55 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0173277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0249  hypothetical protein  25.21 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2178  hypothetical protein  25.22 
 
 
228 aa  52.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303816  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1555  hypothetical protein  26.91 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0170408  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1595  hypothetical protein  26.67 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00605594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1490  hypothetical protein  28.22 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00472854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1304  hypothetical protein  25.34 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.795946  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48538  predicted protein  27.52 
 
 
1027 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>