14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3166 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3166  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  618  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2883  hypothetical protein  47.9 
 
 
310 aa  278  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  44.75 
 
 
293 aa  259  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26660  hypothetical protein  47.52 
 
 
289 aa  259  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.0470074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2065  hypothetical protein  47.76 
 
 
280 aa  258  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.379601  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1931  hypothetical protein  47.6 
 
 
287 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0412826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  47.37 
 
 
280 aa  252  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1065  hypothetical protein  44.64 
 
 
289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5394  hypothetical protein  42.29 
 
 
343 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  32.95 
 
 
265 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  29.75 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43168  predicted protein  26.79 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0764415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0689  hypothetical protein  28.29 
 
 
252 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>