16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2883 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2883  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  634    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3166  hypothetical protein  47.9 
 
 
298 aa  278  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.578089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  49.28 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26660  hypothetical protein  49.11 
 
 
289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.0470074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2065  hypothetical protein  48.92 
 
 
280 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.379601  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  46.34 
 
 
293 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1931  hypothetical protein  47.5 
 
 
287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0412826  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1065  hypothetical protein  46.21 
 
 
289 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.390948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5394  hypothetical protein  46.64 
 
 
343 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  32.71 
 
 
259 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  32.95 
 
 
265 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  28.3 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43168  predicted protein  28.32 
 
 
282 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0764415  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4242  2OG-Fe(II) oxygenase  22.55 
 
 
269 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4124  2OG-Fe(II) oxygenase  22.55 
 
 
269 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  27.55 
 
 
254 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>