16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2345 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2345  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  318  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  30.97 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  30.06 
 
 
201 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  27.78 
 
 
201 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  29.01 
 
 
163 aa  57.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  29.01 
 
 
163 aa  57.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  28.57 
 
 
201 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  28.4 
 
 
201 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  29.52 
 
 
207 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  28.48 
 
 
201 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  30.99 
 
 
208 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  28.92 
 
 
201 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  30 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  28.1 
 
 
208 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.64 
 
 
184 aa  41.2  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.48 
 
 
184 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>