12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6719 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6719  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  744    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.759063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2685  hypothetical protein  57.36 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282963  normal  0.122648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4172  hypothetical protein  59.38 
 
 		 349 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204573  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02335  hypothetical protein  41.69 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15036  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  40.63 
 
 		 582 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1343  putative secreted protein  37.95 
 
 		 361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00928694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1858  hypothetical protein  38.56 
 
 		 342 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5318  hypothetical protein  26.73 
 
 		 329 aa  53.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224058  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03172  putative signal peptide protein  24.71 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.203589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2391  lipoprotein  22.97 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal  0.755106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4492  hypothetical protein  26.03 
 
 		 275 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4360  hypothetical protein  23.41 
 
 		 352 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>