18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6603 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6603  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  696    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1369  hypothetical protein  39.3 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05140  hypothetical protein  42.53 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0093  hypothetical protein  40.62 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0720  hypothetical protein  38.53 
 
 		 370 aa  189  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0611  hypothetical protein  36.72 
 
 		 375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1597  hypothetical protein  37.12 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1867  hypothetical protein  37.74 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0592  hypothetical protein  37.89 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.60475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4849  hypothetical protein  31.86 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3719  hypothetical protein  31.16 
 
 		 483 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1247  hypothetical protein  29.95 
 
 		 560 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.477424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3759  hypothetical protein  27.27 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2547  hypothetical protein  24.93 
 
 		 627 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5988  hypothetical protein  28.68 
 
 		 475 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7754  hypothetical protein  25.97 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.904748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7173  hypothetical protein  26.11 
 
 		 580 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142604  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1604  hypothetical protein  26 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>