30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6310 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6310  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.639142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2278  hypothetical protein  73.96 
 
 
265 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.869432  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3514  hypothetical protein  70.57 
 
 
265 aa  394  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0146  hypothetical protein  71.26 
 
 
261 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.445044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2564  hypothetical protein  68.63 
 
 
260 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2151  hypothetical protein  63.71 
 
 
265 aa  352  2.9999999999999997e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0128892  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2571  hypothetical protein  55.34 
 
 
258 aa  288  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850866  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3204  hypothetical protein  55.81 
 
 
258 aa  287  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.014379  normal  0.501586 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2531  hypothetical protein  52.67 
 
 
269 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1549  hypothetical protein  52.27 
 
 
265 aa  279  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.237876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2213  hypothetical protein  53.75 
 
 
259 aa  271  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1722  hypothetical protein  52.51 
 
 
259 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2156  hypothetical protein  53.67 
 
 
259 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1589  hypothetical protein  48.5 
 
 
266 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1793  hypothetical protein  52.9 
 
 
259 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0086  hypothetical protein  52.08 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1633  hypothetical protein  54.44 
 
 
259 aa  251  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3366  hypothetical protein  48.62 
 
 
277 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1956  hypothetical protein  48.13 
 
 
255 aa  232  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0268336  hitchhiker  0.00000346818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1969  hypothetical protein  46.15 
 
 
269 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1808  hypothetical protein  47.66 
 
 
249 aa  228  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2346  hypothetical protein  48.58 
 
 
259 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.519999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5504  hypothetical protein  51.82 
 
 
273 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.249889  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1064  hypothetical protein  44.4 
 
 
285 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3619  hypothetical protein  45.78 
 
 
261 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142285  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13600  hypothetical protein  48.58 
 
 
307 aa  201  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.487374  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1363  hypothetical protein  25.76 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0581  hypothetical protein  26.82 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0568  hypothetical protein  26.7 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0794762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0892  hypothetical protein  26.32 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0979005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>