17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6305 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  687    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  37.13 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  32.46 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  27.71 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  23.4 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  25.71 
 
 		 406 aa  99.4  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  31.93 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  29.37 
 
 		 354 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  24.61 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  39.56 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  35.85 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  20.56 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  36.05 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  29.27 
 
 		 233 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  30.77 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  25.45 
 
 		 428 aa  57  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1391  hypothetical protein  28.24 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>