22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5793 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  310  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  54.55 
 
 		 152 aa  167  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  54.61 
 
 		 152 aa  157  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  46.75 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  47.37 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  39.35 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4463  hypothetical protein  35.29 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235508  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0815  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  30.56 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  32.21 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  33.1 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  33.1 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  31.86 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  32.14 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1779  hypothetical protein  32.43 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155662  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02620  hypothetical protein  29.63 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  32.28 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0023  hypothetical protein  29.61 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0746  hypothetical protein  29.87 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1109  hypothetical protein  29.75 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000177487  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0396  hypothetical protein  25.74 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0181  hypothetical protein  27.63 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>