77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5254 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  68.75 
 
 		 142 aa  211  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  57.93 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  56.94 
 
 		 144 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  55.56 
 
 		 143 aa  175  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  52.86 
 
 		 146 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  52.14 
 
 		 146 aa  157  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  47.92 
 
 		 152 aa  155  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  47.22 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  48.63 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  48.32 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  47.55 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  42.45 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  41.13 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  38.57 
 
 		 146 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  37.86 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  36.88 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  38.57 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  28.77 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  35.46 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  32.43 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  34.23 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  34.53 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  32.65 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  31.29 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  28.77 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  33.79 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  29.03 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.61 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  33.77 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  31.88 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  31.88 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  37.86 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  30.34 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  36.11 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  28.26 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  30.34 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  33.8 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  37.1 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  28.08 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  30.08 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  33.86 
 
 		 178 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  31.94 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  32.87 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  27.89 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  29.5 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  31.39 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  32.87 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  27.86 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  27.66 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  28.47 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  28.08 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  26.32 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  29.17 
 
 		 194 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  30.47 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  26.87 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  29.85 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1757  phage tail protein  27.59 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1129  hypothetical protein  30.34 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  30.95 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  30.07 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  28.8 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  26.9 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  27.54 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2563  hypothetical protein  24.83 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00285487  hitchhiker  0.0000000213199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  23.24 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  25.95 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  24.46 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  23.24 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  27.03 
 
 		 159 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  23.91 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  23.31 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>