19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4071 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4071  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1301    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184175  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0339  hypothetical protein  29.79 
 
 		 639 aa  253  5.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.809143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0364  hypothetical protein  27.64 
 
 		 683 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2475  hypothetical protein  28.19 
 
 		 611 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.641856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1656  hypothetical protein  25.79 
 
 		 627 aa  162  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.558221  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2958  hypothetical protein  25 
 
 		 609 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725385  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3442  hypothetical protein  24.51 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.325746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3673  hypothetical protein  36.19 
 
 		 546 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0272  hypothetical protein  36.19 
 
 		 546 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3685  hypothetical protein  29.65 
 
 		 549 aa  62.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3877  hypothetical protein  35.24 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.413132  normal  0.0515255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0306  hypothetical protein  33.65 
 
 		 503 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3984  hypothetical protein  33.02 
 
 		 548 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4062  hypothetical protein  33.02 
 
 		 548 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4093  hypothetical protein  32.08 
 
 		 548 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4180  hypothetical protein  32.08 
 
 		 548 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3352  hypothetical protein  26.61 
 
 		 546 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0286  hypothetical protein  25.45 
 
 		 546 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399443  hitchhiker  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0379  hypothetical protein  30.91 
 
 		 543 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>