64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3923 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  58.67 
 
 		 152 aa  187  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  57.42 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  54.55 
 
 		 157 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  54 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  47.1 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  47.14 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  49.64 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  47.55 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  43.57 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  39.74 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  39.74 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  37.41 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  32.39 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  32.45 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  36.03 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  32.67 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  25.87 
 
 		 150 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  34.56 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  35.04 
 
 		 146 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  34.78 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  31.88 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  34.43 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  30.5 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  33.06 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  32.62 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  27.56 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  26.71 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  31.71 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  27.27 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  30.34 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  31.25 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  26.89 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  28.77 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.17 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  31.87 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  29.08 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  29.63 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  33.9 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  35.83 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  30.5 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  30.22 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  24.84 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  24.26 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  29.93 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  24 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  28.08 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  26.45 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  21.79 
 
 		 174 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  26.97 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  26.47 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  26.21 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  25.52 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  27.01 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  28.74 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  25 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  27.97 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  27.52 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  24.82 
 
 		 150 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  25.38 
 
 		 194 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  23.94 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>