20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3775 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3775  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0018527  hitchhiker  0.00917662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4139  hypothetical protein  49.34 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.24606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2548  hypothetical protein  51.32 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5793  hypothetical protein  47.37 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0897  hypothetical protein  38.82 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3661  hypothetical protein  33.99 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3253  hypothetical protein  35.66 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0930132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6869  hypothetical protein  30.87 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.640003  normal  0.119892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0815  hypothetical protein  30.72 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351939 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0746  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1159  hypothetical protein  32.64 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4463  hypothetical protein  30.72 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235508  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2555  hypothetical protein  33.93 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0023  hypothetical protein  29.22 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0737  hypothetical protein  26.62 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0181  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000000752164  normal  0.677539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4171  hypothetical protein  30.16 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000102963  hitchhiker  0.000000290643 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0396  hypothetical protein  28.28 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2059  hypothetical protein  29.49 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.535372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02620  hypothetical protein  25.19 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>