44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2048 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  60.56 
 
 		 500 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  60.44 
 
 		 510 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  60.93 
 
 		 500 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 497 aa  1027    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  57.81 
 
 		 494 aa  631  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  61.43 
 
 		 496 aa  630  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  56.3 
 
 		 497 aa  615  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  57.4 
 
 		 495 aa  616  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  53.92 
 
 		 502 aa  565  1e-160  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  36.58 
 
 		 484 aa  334  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  36.44 
 
 		 507 aa  328  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  36.38 
 
 		 502 aa  326  5e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  36.24 
 
 		 504 aa  323  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  34.86 
 
 		 508 aa  320  3e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  34.91 
 
 		 510 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  35.5 
 
 		 507 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  35.31 
 
 		 502 aa  312  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  35 
 
 		 504 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  34.48 
 
 		 522 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  36.17 
 
 		 514 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  36.17 
 
 		 514 aa  291  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  33.62 
 
 		 509 aa  271  1e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  33.47 
 
 		 514 aa  253  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  32.62 
 
 		 521 aa  246  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  33.82 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  34.3 
 
 		 512 aa  237  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  29.28 
 
 		 527 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  29.71 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  30.41 
 
 		 508 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  29.84 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  29.13 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  28.91 
 
 		 530 aa  204  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  27.99 
 
 		 528 aa  193  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  29.94 
 
 		 539 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  22.64 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  22.2 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  72.8  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2824  auxin-responsive GH3-related protein  21.17 
 
 		 487 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0537258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  30.71 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0740  auxin-responsive GH3-related protein  28.06 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  30.95 
 
 		 581 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2698  GH3 auxin-responsive promoter  25.37 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4515  GH3 auxin-responsive promoter  26.62 
 
 		 526 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  20.12 
 
 		 509 aa  43.9  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>