19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1439 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 404 aa  837    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  33.77 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  26.44 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  28.18 
 
 		 466 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  32.33 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3397  Lanthionine synthetase C family protein  23.16 
 
 		 391 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  25.17 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  28.99 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  28.64 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  27.31 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  28.12 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  24.23 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  26.6 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  28.24 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  25.48 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  28.79 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4228  Lanthionine synthetase C family protein  27.75 
 
 		 661 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  27.19 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  25.95 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>