13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1391 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1391  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  22.98 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  27.5 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  30.69 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  32.22 
 
 		 361 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  20.91 
 
 		 351 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  27.06 
 
 		 347 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  25 
 
 		 378 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  27.16 
 
 		 343 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  29.33 
 
 		 331 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  23.08 
 
 		 406 aa  45.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  28.57 
 
 		 428 aa  45.4  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  22.83 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>