18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1312 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  710    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  37.31 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  34.01 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  25.51 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  23.34 
 
 		 425 aa  112  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  25.57 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  24.93 
 
 		 406 aa  92.8  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  44.19 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  24.66 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  26.27 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  24.33 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  36.94 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  31.62 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  28.04 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  28.21 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  28.89 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1391  hypothetical protein  27.06 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04041  hypothetical protein  23.84 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>