24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0336 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0336  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  1005    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0136782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2733  hypothetical protein  49.35 
 
 		 570 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  hitchhiker  0.00174807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0549  hypothetical protein  49.52 
 
 		 542 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1617  hypothetical protein  59.07 
 
 		 579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0550  hypothetical protein  44.98 
 
 		 523 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0552  hypothetical protein  45.63 
 
 		 504 aa  448  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.677753  normal  0.24778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0551  hypothetical protein  43.43 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0557  hypothetical protein  41.67 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2081  hypothetical protein  43.33 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0297326  normal  0.252224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0555  hypothetical protein  42.17 
 
 		 442 aa  365  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.589483  normal  0.442038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0556  hypothetical protein  39.07 
 
 		 515 aa  353  5e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.253273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0337  hypothetical protein  44.4 
 
 		 448 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.058195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2083  hypothetical protein  39.41 
 
 		 493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  0.196729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2732  hypothetical protein  37.87 
 
 		 449 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  hitchhiker  0.00119476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0558  hypothetical protein  38.48 
 
 		 467 aa  326  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.675961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1618  hypothetical protein  38.54 
 
 		 475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.483238  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2082  hypothetical protein  40 
 
 		 476 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  0.181535 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0548  hypothetical protein  40.55 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5342  hypothetical protein  28.63 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0256  DoxX family protein  29.81 
 
 		 448 aa  103  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0868  hypothetical protein  25.14 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06020  hypothetical protein  27.39 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.305074  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4334  hypothetical protein  30.14 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163253  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02555  hypothetical protein  28.95 
 
 		 239 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>