15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1216 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1216  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  616  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.256676  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0819  hypothetical protein  44.59 
 
 
302 aa  262  6e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0932  hypothetical protein  48.04 
 
 
303 aa  261  6.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0973643 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1201  hypothetical protein  47.72 
 
 
245 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.800385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1412  hypothetical protein  30 
 
 
282 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2866  hypothetical protein  30.04 
 
 
277 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11403  hypothetical protein  29.53 
 
 
296 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.306099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2479  hypothetical protein  29.66 
 
 
293 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.322617  normal  0.362973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2539  hypothetical protein  29.83 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3751  hypothetical protein  25.68 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  27.27 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  27.27 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>