17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0611 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0611  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  766    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0811954 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0720  hypothetical protein  63.74 
 
 
370 aa  485  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1867  hypothetical protein  63.74 
 
 
449 aa  478  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0592  hypothetical protein  64.56 
 
 
368 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.60475  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1597  hypothetical protein  62.86 
 
 
369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0093  hypothetical protein  48.91 
 
 
361 aa  328  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6603  hypothetical protein  36.39 
 
 
338 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05140  hypothetical protein  36.56 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1369  hypothetical protein  33.23 
 
 
366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4849  hypothetical protein  28.02 
 
 
414 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3719  hypothetical protein  25.73 
 
 
483 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7754  hypothetical protein  29.94 
 
 
466 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.904748  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1247  hypothetical protein  26.82 
 
 
560 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.477424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7173  hypothetical protein  32.37 
 
 
580 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142604  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1604  hypothetical protein  33.61 
 
 
452 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3759  hypothetical protein  25.37 
 
 
461 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5988  hypothetical protein  38.03 
 
 
475 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>