21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1405 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1405  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0111  hypothetical protein  69.23 
 
 
66 aa  96.7  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000142906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1564  hypothetical protein  74.58 
 
 
59 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.179867  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0855  hypothetical protein  74.55 
 
 
60 aa  88.2  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132485  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1365  putative transcriptional regulator  63.08 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1000  hypothetical protein  65.52 
 
 
59 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1152  hypothetical protein  55.17 
 
 
58 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0115619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0209  hypothetical protein  53.45 
 
 
58 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0605  hypothetical protein  55.17 
 
 
58 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0301  hypothetical protein  64.29 
 
 
42 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0854727 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03840  hypothetical protein  65.12 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2006  hypothetical protein  48.21 
 
 
60 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000251834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0880  hypothetical protein  49.09 
 
 
59 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0046955  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2942  hypothetical protein  47.17 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0885  hypothetical protein  49.09 
 
 
57 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1298  hypothetical protein  49.15 
 
 
59 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1200  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  49.09 
 
 
61 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0190217  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2088  hypothetical protein  45.28 
 
 
57 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1168  hypothetical protein  37.74 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0792  hypothetical protein  37.1 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.894596  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0810  hypothetical protein  35.94 
 
 
74 aa  40  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.469671  hitchhiker  0.000145484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>